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品牌 | illumina/美國因美納 | 供貨周期 | 現貨 |
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應用領域 | 醫療衛生,生物產業 |
產品名稱:illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set A
產品貨號:IP-202-1012
產品說明:
測定時間 從芯片DNA到1.5天
輸入量 5 ng芯片dna
系統兼容性 HiSeq 1000,HiSeq 1500,HiSeq 2000HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, 米塞克, 研究模式下的MiSeqDx, NextSeq 500, NextSeq 550
特殊樣本類型 低輸入樣本
物種類別 酵母,老鼠,果蠅,人,斑馬魚,細菌,線蟲,任何物種,老鼠,植物
技術 測序
方法 切克
核酸型 脫氧核糖核酸
產品介紹:
illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒用于Chlp來源DNA的染色質免疫沉淀測序文庫制備。大約1.5天完成5ng DNA文庫的制備。TruSeq芯片Libary準備試劑盒為從芯片衍生DNA生成染色質免疫沉淀測序(芯片-Seq)庫提供了一種簡單、成本效益高的解決方案。芯片-seq利用下一代測序(NGS)快速而有效地確定基因組中所關注的dna結合蛋白的分布和豐度。這種方法已成為zui廣泛應用的NGS應用之一,使研究人員能夠可靠地同時識別整個基因組中廣泛目標的結合位點,具有高分辨率和無約束。
產品名稱:illumina授權代理商 文庫制備試劑盒A 產品貨號:IP-202-1012
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illumina代理商:重慶市華雅干細胞技術有限公司
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illumina IP-202-1012 illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set A
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產品名稱:illumina Truseq Chlp Library PreparationKit文庫制備試劑盒TruSeq ChlP Library Preparation Kit-Set A
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Illumina二代測序技術,邊合成邊測序(SBS),是廣泛采用的新一代測序(NGS)技術,負責產生世界上90%以上的測序數據。
Illumina的二代測序技術稱為邊合成邊測序(Sequencing-by-Synthesis,簡稱SBS)。SBS主要包括堿基延伸、熒光激發及信號收集、剪切等3個步驟。這3個步驟可以重復,循環進行。每循環一次測定一個堿基。想測定多少個堿基(即讀長),就循環多少次。測序循環次數可以在軟件里設定。到底測序多長合適,要根據項目性質和需求來決定。大多數情況下,SR實驗(單端測序)測定1x50個堿基,PE實驗(雙端測序)測定2x150個堿基。
1 堿基延伸
Illumina測序試劑里所使用的dNTP極ju特色,它們同時具有兩個修飾基團:一個熒光基團,一個可逆終止基團。A、G、C、T 4種堿基分別標記4種不同的熒光基團,它們在不同波長的激光激發下,能夠發射不同波長(即顏色)的熒光。熒光顏色與堿基種類一一對應,因此根據激發光的波長可以識別堿基。4種堿基的終止基團是一樣的。由于終止基團的存在,所有dNTP每次都只能延伸1個堿基,無論給予多長的反應時間。又由于該終止基團是可逆的,在熒光信號收集完畢之后,可以用剪切劑切除該終止基團,使堿基恢復自然的可延伸狀態,這時即可繼續進行下一輪循環,再測定一個堿基。
可逆終止基團技術是Illumina二代測序的一大特色。它與橋式PCR技術一起,構成了Illumina二代測序的兩大支柱,為穩定獲得高質量的測序數據打下了堅實的基礎。
2 信號采集
HiSeq系列測序儀具有紅綠兩根激光管,兩個濾色片。它們兩兩組合,可以形成4種不同的激發波長,正好分別用于激發A、G、C、T 4種堿基。
Cluster上所標記的熒光基團在激光激發下產生的信號,可以用相機拍攝或者掃描的方式收集信號。掃描技術速度比較快,被X10系列采用。由于FC面積比較大,而且上表面和下表面要分別拍照,所以拍照過程相當耗時。對于經典的HiSeq 2000來說,一次測序循環所產生的熒光信號,需要大約40分鐘的時間才能拍照收集完畢,時間比測序反應本身還要長。
3 剪切
熒光信號收集完畢后,關閉激光,用剪切劑去除測序引物的延伸產物上的堿基所標記的熒光基團和終止基團。兩個修飾基團均被切除,一方面消去干擾熒光,一方面使鏈末端的堿基回復到自然的可延伸狀態,為下一輪測序做好準備。
再重復合成、激發、收集等步驟,即可進行第二個堿基的測序。
測序循環可以重復多次。理論上可以一直重復,直到信噪比降低得無法有效識別堿基信號為止。由于熒光基團的發光效率持續不斷在衰減,Taq酶的活性也在持續不斷地衰減,所以實際上測序循環次數是有限的,大重復次數與sbs試劑的配方有關。測序的循環次數可以在軟件設置過程中人為,這個重復次數就是每個測序片段的讀長。目前,Illumina平臺的讀長有2x100 bp,2x125 bp,2x150 bp,2x300 bp等多種,其中2x150 bp用得zui廣泛。
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