單細胞全基因組擴增試劑盒 PicoPLEX® WGA Kit PGS

 TAKARA/ Clontech Rubicon Genomics（RB3050/R30050）

 Rubicon Genomics成立于2000年，總部位于美國密歇根州，致力于研究和開發(fā)基因組（Genomics Amplification）技術(shù)，其產(chǎn)品廣泛應(yīng)用于NGS測序文庫的構(gòu)建和單細胞水平的研究。 Rubicon Genomics （RB3050/R30050） PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒用于PCR和基因芯片文庫制備，以檢測拷貝數(shù)變異和染色體的非整倍性。長期以來，PicoPLEX WGA Kits 一直得到體外受精（IVF）同盟成員中的ling先供應(yīng)商比如 BlueGnome（Illumina 公司）的信任并用于胚胎植入前遺傳學(xué)篩查和診斷（PGS/PGD）。

    單細胞DNA擴增生成高重現(xiàn)性文庫已不再是夢想。PicoPLEX™ WGA試劑盒經(jīng)zhuan利技術(shù)設(shè)計和優(yōu)化，于單個細胞的單拷貝基因組DNA擴增，整個過程在單管中進行，減少了操作誤差，顯著縮短了時間，降低了背景值。分離所獲達6 pg to 50 pg g量的DNA也可以使用PicoPLEX™ WGA試劑盒構(gòu)建文庫。所獲產(chǎn)物用于芯片比較基因組雜交(CGH)分析和PCR反應(yīng)。受美國zhuan利保護。從單細胞(或<15 pg DNA)獲得高重現(xiàn)性的結(jié)果等位基因呈現(xiàn)(allele representation)具重現(xiàn)性應(yīng)用簡單，自動化水平高，芯片和PCR結(jié)果清晰 。

     Rubicon Genomic正式更名為TAKARA/ Clontech

TAKARA/ Clontech 超過30年的服務(wù)生命科學(xué)研究領(lǐng)域，并支持各種實驗應(yīng)用的試劑盒和試劑，專注細胞和分子生物學(xué)研究。Clontech Laboratories, Inc.(現(xiàn)Takara Bio USA, Inc.)。

TAKARA/ Clontech Rubicon Genomics單細胞全基因組擴增試劑盒訂貨信息

    TAKARA/ Clontech  R30050   PicoPLEX™ WGA Kit,   50 reactions

    TAKARA/ Clontech  R300644  PicoPLEX™ WGA Kit,   500 reactions

    TAKARA/ Clontech  R300671  SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit 24Rxns

    TAKARA/ Clontech  R300672  SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit 960Rxns

 TAKARA/ Clontech  R300673  SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit 480Rxns

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單細胞全基因組擴增試劑盒 PicoPLEX® WGA Kit特性：

1. 單細胞擴增高重性


      使用 PicoPLEX WGA Kit 擴增流式分選的細胞。每個細胞以相同的速率擴增，并得到一個類似的，可預(yù)測的產(chǎn)量。樣品含 0 個細胞（無模板對照）顯示出非常低的背景。
2. CNV數(shù)據(jù)高重現(xiàn)性

PicoPLEX WGA Kit 擴增單卵裂球活檢標(biāo)本，Genesis 遺傳研究院完成標(biāo)記和雜交 BlueGnome 的 24sure 芯片。
3. 等位基因表達研究高重現(xiàn)性

       位點特異的q-PCR定量分析獨立的單細胞文庫(independent single-celllibraries)中的48位點。從左到右三個圖顯示的是用10 pg DNA分別使用PicoPLEX WGA試劑盒，GenomePLEX?和GenomiPhi所獲結(jié)果。90%的PicoPLEX產(chǎn)物可經(jīng)測序序列證實，可重復(fù)性高。

【產(chǎn)品應(yīng)用】

     PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒的適用范圍十分廣泛，多種原始材料和微量樣品均可通過該試劑盒進行單細胞全基因組擴增，隨著國家二胎政策的開放，在胚胎植入前遺傳學(xué)篩查和診斷（PGS/PGD）應(yīng)用尤其廣泛；

•生物標(biāo)志物研究（CNVs、SNVs） •體外受精胚胎植入前基因測序           •轉(zhuǎn)基因動物基因分型 •胚胎和干細胞研究 •單精子分型 腫瘤 •體細胞遺傳變異分析            •腫瘤進化和發(fā)展 

•腫瘤干細胞 •循環(huán)腫瘤細胞 細菌 •宏基因組學(xué)研究  •微生物基因分型

單細胞全基因組擴增試劑盒 PicoPLEX® WGA Kit問與答：

1. PicoPLEX WGA試劑盒的推薦DNA輸入是什么?

1-10人細胞(如囊胚、極體、滋養(yǎng)細胞、羊膜細胞、CTCs、培養(yǎng)細胞

2. PicoPLEX®WGA試劑盒推薦哪些應(yīng)用程序?

拷貝數(shù)變異(CNV)分析:寡核苷酸和BAC aCGH較好

SNP基因分型

PCR檢測突變

3.在使用PicoPLEX WGA試劑盒之前，是否有一種不粘接的洗滌緩沖液可以用于單細胞洗滌?

這還沒有在Rubicon基因組公司得到證實，但一些客戶已經(jīng)成功地使用了聚乙烯醇;例如0.1%)在PBS中清洗/收集細胞。此外，洗滌/收集緩沖液(PBS)也必須是無Ca和mg的。

4. 流程排序有特殊要求嗎?

是的，我們強烈建議不要固定，使用光散射或相位對比來分類或收集樣品。成功分選細胞的顯微/視覺確認可用于優(yōu)化分選條件。

5. PicoPLEX WGA試劑盒的樣品輸入體積是多少?

這個工具包將容納5μl示例輸入音量/反應(yīng)多(2.5μl移行細胞和緩沖區(qū))。

6. PicoPLEX WGA Kit的產(chǎn)品可以直接帶到NGS嗎?

不。

7. Rubicon Genomics是否有適合單細胞應(yīng)用的ngs試劑盒?

是的，PicoPLEX DNA-seq可以用于Illumina NGS平臺。

8. Sigma-Aldrich銷售的是GenomePlex WGA工具包，它與PicoPLEX WGA的技術(shù)相同嗎?

不，PicoPLEX使用不同的技術(shù)。

9. 對于PicoPLEX WGA產(chǎn)品，預(yù)期的基因組位點表示和雜合度損失(LOH)是什么?

為便于參考，請參閱下表中從第三方獲得的數(shù)據(jù)。

SNP基因分型方法單細胞擴增

snp呼叫成功率

pcr 95% > 95% < 10%

Illumina Infinium SNP陣列占95% 50% - 60% 7% - 12%

10. 這種技術(shù)的產(chǎn)物是單鏈的還是雙鏈的?

PicoPLEX WGA的終產(chǎn)物是單鏈和雙鏈DNA的混合物。

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